中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)論文特征分析

時(shí)間:2022-12-09 04:47:18

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中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)論文特征分析

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(Networkpharmacology)一詞于2007年由英國鄧迪大學(xué)AndrewLHopkins首次提出,并于2008年進(jìn)行了具體闡釋——指運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)方法分析藥物與疾病之間的“多成分、多靶點(diǎn)、多途徑”的協(xié)同作用關(guān)系的藥理學(xué)分支學(xué)科[1-2]。其對于“疾病-基因-靶點(diǎn)-藥物”相互作用的網(wǎng)絡(luò)分析方法,為中醫(yī)藥的現(xiàn)代研究與發(fā)展提供了新的思路與途徑。成分的復(fù)雜性、方劑配伍的多樣性、辨證論治的差異性,使中醫(yī)藥的現(xiàn)代化受到了一定限制。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的引入、應(yīng)用與發(fā)展,可助推中醫(yī)藥的現(xiàn)代化進(jìn)程。自2010年,應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析中醫(yī)藥的文章發(fā)表數(shù)量逐年增多,對此,我們希望從文獻(xiàn)的角度對已發(fā)表的文章進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,了解網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在中醫(yī)藥研究領(lǐng)域的應(yīng)用現(xiàn)狀。本文采用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)方法[3],即綜合運(yùn)用文獻(xiàn)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、數(shù)學(xué)來定量分析一切知識載體的方法,對PubMed、WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫中應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法研究中醫(yī)藥相關(guān)問題的文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì),重點(diǎn)分析作者單位分布、研究內(nèi)容、來源期刊以及所引參考文獻(xiàn)等,評價(jià)目前國內(nèi)外中醫(yī)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的科研水平,總結(jié)研究熱點(diǎn),分析研究趨勢,為學(xué)者今后的研究提供方向。

1材料與方法

1.1納入標(biāo)準(zhǔn)與排除標(biāo)準(zhǔn)。1.1.1納入標(biāo)準(zhǔn)。運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究中醫(yī)藥的內(nèi)容,如復(fù)方、中藥、中藥成分、證等,均可被納入。文獻(xiàn)檢索的年份設(shè)定在2008—2018年。語言不設(shè)限定。1.1.2排除標(biāo)準(zhǔn)①研究方法未涉及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)內(nèi)容,而僅提到“網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”;②研究內(nèi)容未涉及中醫(yī)藥(含少數(shù)民族醫(yī)藥)領(lǐng)域相關(guān)問題,如:現(xiàn)代化學(xué)藥品、合成藥、植物藥、外國藥物等,或僅提到“中醫(yī)藥”“中醫(yī)”;③僅做綜述,meta-analysis,論述,社論;④數(shù)據(jù)庫平臺建設(shè)等。1.2資料來源與文獻(xiàn)篩選。文獻(xiàn)檢索范圍為PubMed與WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫,以“networkpharmacology”作為主題詞進(jìn)行檢索,納入包含主題詞為“TCM”或“traditionalChinesemedicine”或“Chineseherbs”并且發(fā)表年份在2008—2018年,檢索式為:((networkpharmacology)AND(traditionalChinesemedicineorTCMorChineseherbs))AND("2007"[Date-Publication]:"2018"[Date-Publication])。文獻(xiàn)檢索由2位研究者同時(shí)獨(dú)立進(jìn)行,閱讀所獲文獻(xiàn)題錄和摘要,去除重復(fù)題錄和排除明顯不符合納入標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)。之后,下載所有文獻(xiàn)的原文,進(jìn)行一一核實(shí),并交叉核對所納入的文獻(xiàn)。對有分歧而難以確定的,由小組成員共同研究、討論,或由第3位研究者決定。1.3分析方法所有相關(guān)信息均納入Excel,進(jìn)行頻數(shù)統(tǒng)計(jì)與分析。數(shù)據(jù)采用SPSS.20進(jìn)行描述性分析。

2結(jié)果

2.1檢索結(jié)果。根據(jù)上述檢索策略,我們在PubMed和WebofScience兩大外文數(shù)據(jù)庫分別檢索到與中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)相關(guān)文獻(xiàn)717和374篇。導(dǎo)出題錄與摘要,剔除重復(fù)文獻(xiàn),共獲得原始題錄844篇。根據(jù)上述納入、排除標(biāo)準(zhǔn),由兩名研究者分別對題錄與摘要進(jìn)行初步篩選,初步納入文獻(xiàn)316篇,待核實(shí)文獻(xiàn)273篇。之后,下載所有原文,進(jìn)行再次復(fù)核,納入文獻(xiàn)112篇,最后由小組成員共同商議或第3位研究者決定,納入19篇。最終,納入447篇全文文獻(xiàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。2.2發(fā)表年份與數(shù)量。按照納入標(biāo)準(zhǔn),中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的文章于2008年開始發(fā)表,但數(shù)量較少,僅有2篇[4-5],但真正介紹中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的文章,則由中國第二軍醫(yī)大學(xué)張衛(wèi)東教授團(tuán)隊(duì)在2009年發(fā)表[6]。在隨后的4年里,這方面的文章亦不是很多,從2013年開始逐漸增多,而增幅最大的當(dāng)屬2017、2018兩年,尤其是2018年,有關(guān)中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)文章的發(fā)表首次突破100篇。見圖1。2.3發(fā)表地區(qū)分布情況。2.3.1第一作者所屬單位分布情況。據(jù)統(tǒng)計(jì),以第一作者單位發(fā)表,分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計(jì)487篇次(注:某些第一作者單位不唯一,統(tǒng)計(jì)時(shí)分別計(jì)算;下同),其中北京占有132篇次,達(dá)27.10%。筆者對國內(nèi)前10名第一作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),結(jié)果見表1。同時(shí),我們進(jìn)一步細(xì)分了第一作者單位在北京的分布情況,發(fā)現(xiàn)前5位的機(jī)構(gòu)分別是中國中醫(yī)科學(xué)院(55篇)、北京中醫(yī)藥大學(xué)(34篇)、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院(11篇)、清華大學(xué)(9篇)及中國人民解放軍第302醫(yī)院(7篇)。再者,我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)第一作者單位隸屬國外,分別來自于美國(4篇)、德國(2篇)和韓國(1篇)及澳大利亞(1篇)。2.3.2共同第一作者所屬單位分布情況。所納入的文獻(xiàn)中,173篇含有共同第一作者,其所在單位分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計(jì)188篇次,其中北京55篇次,達(dá)29.26%。同時(shí),我們對國內(nèi)前10名共同第一作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),結(jié)果見表1。統(tǒng)計(jì)時(shí),我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)共同第一作者單位隸屬國外,分別來自于美國(5篇)、德國(1篇)、韓國(1篇)、埃及(1篇)及澳大利亞(1篇)。2.3.3通訊作者所屬單位分布情況。在447篇納入的文獻(xiàn)中,均有通信作者,以通信作者單位發(fā)表,分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計(jì)444篇次,其中北京123篇次,達(dá)27.70%。同時(shí),我們對國內(nèi)前10名通信作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),結(jié)果見表1。再者,我們進(jìn)一步細(xì)分了通信作者單位在北京的分布情況,發(fā)現(xiàn)前5位的機(jī)構(gòu)分別是中國中醫(yī)科學(xué)院(47篇)、北京中醫(yī)藥大學(xué)(30篇)、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院(12篇)、中國人民解放軍第302醫(yī)院(10篇)、北京大學(xué)(9篇)及清華大學(xué)(9篇)。與此同時(shí),我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)通信作者單位隸屬國外,分別來自于美國(4篇)、德國(2篇)、巴基斯坦(2篇),埃及(2篇),韓國(1篇)及澳大利亞(1篇)。2.3.4共同通信作者所屬單位分布情況。所納入的文獻(xiàn)中,214篇含有共同通信作者,其所在單位分布國內(nèi)不同省、直轄市及特別行政區(qū)共計(jì)262篇次,其中北京81篇次,達(dá)30.92%。同時(shí),我們對國內(nèi)前10名共同通信作者單位所在的省、直轄市及特別行政區(qū)進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),結(jié)果見表1。再者,統(tǒng)計(jì)時(shí),我們也發(fā)現(xiàn)少數(shù)共同通信作者單位隸屬國外,分別來自于美國(8篇)和韓國(1篇)。2.3.5跨國合作情況。在所納入的文獻(xiàn)中,我們發(fā)現(xiàn)與國外合作的有9篇(分別來自于美國3篇、巴基斯坦2篇、埃及2篇、以色列1篇、澳大利亞1篇),此外,有2篇完全來自于德國,1篇來自于韓國,還有1篇由美國與韓國合作。2.4研究內(nèi)容。2.4.1研究載體。自從HopkinsAL于2007年10月份在NatureBiotechnology發(fā)文初步論述其對網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的認(rèn)識之后,2008年就有有關(guān)中醫(yī)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的文章發(fā)表,經(jīng)過10余年的發(fā)展,有關(guān)中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)文數(shù)量呈逐年上升趨勢,增幅較大的發(fā)生在2017、2018年,所涉及的研究載體包括中藥復(fù)方、數(shù)味中藥(注:文中未提及具體方劑,又不屬于配伍或藥對的2味及2味以上的藥物組合)、配伍、單味藥、中藥成分及證候研究。其中,中藥復(fù)方類研究最多(223篇次),其次為中藥成分,單味藥及數(shù)味中藥次之,緊接其后的是配伍,而具有中醫(yī)特色的證的研究論文最少。結(jié)果見表2。再者,我們對中藥復(fù)方類進(jìn)行了細(xì)分,發(fā)現(xiàn)自擬方占據(jù)復(fù)方類研究的一半之多(130/223),時(shí)方與經(jīng)方(注:限定為張仲景《傷寒雜病論》中所載方劑),分別為49和40篇次。因有5篇文章,存在經(jīng)方、時(shí)方、自擬方2種及2種以上的混合研究,故在統(tǒng)計(jì)時(shí),采取重復(fù)計(jì)算。2.4.2研究方向。在納入的447篇文獻(xiàn)中,所涉及的研究方向包括藥物作用機(jī)制、分子機(jī)制、炮制、中醫(yī)四氣、藥物毒理、臟器毒理、氣與血的分子機(jī)制、證及疾病機(jī)制等,共計(jì)481篇次。若以世界衛(wèi)生組織頒布的ICD-11疾病系統(tǒng)分類[7],則共計(jì)423篇次(含傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)病證7篇次),排名前5位的分別是循環(huán)系統(tǒng)疾?。?5篇次)、腫瘤(76篇次)、消化系統(tǒng)疾?。?3篇次)、神經(jīng)系統(tǒng)疾?。?5篇次)以及肌肉骨骼系統(tǒng)或結(jié)締組織疾?。?2篇次)。對腫瘤進(jìn)一步細(xì)分,發(fā)現(xiàn)運(yùn)用中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究乳腺癌、結(jié)直腸癌及肝癌的較多,分別為11、10及7篇次。2.5.3論文提出預(yù)測后的驗(yàn)證情況。通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),對數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,這是一種預(yù)測,其對預(yù)測結(jié)果正確與否,需要進(jìn)一步的驗(yàn)證。在447篇文獻(xiàn)中,有166篇文章進(jìn)行了驗(yàn)證(注:文獻(xiàn)驗(yàn)證、分子對接仿真實(shí)驗(yàn)等驗(yàn)證方式,并未計(jì)算在內(nèi))。從表3可以看出,在2013年以前,中醫(yī)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對預(yù)測結(jié)果驗(yàn)證較少,累計(jì)不足驗(yàn)證文獻(xiàn)的10%,而從2015年開始,預(yù)測結(jié)果的驗(yàn)證比例上升趨勢很明顯,尤其是2018年一年,其驗(yàn)證文獻(xiàn)占全部驗(yàn)證文獻(xiàn)的近1/3。再者,在166篇驗(yàn)證的文獻(xiàn)中,13篇文獻(xiàn)發(fā)表于非SCI期刊,內(nèi)含2篇以中文發(fā)表的國內(nèi)期刊,剩余153篇,均發(fā)表于SCI期刊。2.5期刊分布。所納入文獻(xiàn),共發(fā)表于105種期刊,中文刊僅有4種,分別為中國中藥雜志(45篇)、藥學(xué)學(xué)報(bào)(7篇)、中國中西醫(yī)結(jié)合雜志(1篇)、中南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)(1篇),合計(jì)發(fā)表54篇,占12.08%(54/447)。在剩余的101中英文期刊中,據(jù)2018年JCR引證報(bào)告,除AfricanJournalofTraditional,ComplementaryandAlternativeMedicines(未被納入),BiomedicalReports(未被納入),ChineseScienceBulletin(未被納入),CellularPhysiologyandBiochemistry(被剔除),Oncotarget(被剔除)和TumorBiology(被剔除)外,其余95種刊物,均為SCI。2.6參考文獻(xiàn)引用情況。普賴斯指數(shù)是指近5年文獻(xiàn)占所引文獻(xiàn)中的比例,它可以從側(cè)面反映出期刊所載論文(引文)的新穎性和使用壽命,是一種衰減系數(shù)[8]。普賴斯指數(shù)越大,文獻(xiàn)越新穎,其老化的速度也越快。在納入的文獻(xiàn)中,我們根據(jù)語種不同,統(tǒng)計(jì)了文獻(xiàn)不同年份所引用的文獻(xiàn)總數(shù)、相對近5年文獻(xiàn)引用數(shù)、平均引用文獻(xiàn)數(shù)及普賴斯指數(shù),見表6。

3討論

“網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”從提出至今也有13年,當(dāng)初Hopkins意識到“一藥一靶一病”的不足,結(jié)合先前的系統(tǒng)生物學(xué)和多向藥理學(xué),通過對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,他指出多成分、多靶點(diǎn)藥物對復(fù)雜疾病起到了很好的治療效果。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的系統(tǒng)性和整體性思維模式與中醫(yī)藥理論不謀而合,其已成為當(dāng)前中醫(yī)藥現(xiàn)代化研究的新的技術(shù)手段[9],為此梳理十余年的中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的現(xiàn)狀對當(dāng)下熱點(diǎn)和今后的發(fā)展趨勢進(jìn)行判斷很有必要。趙芳卿等[10]選用WebofScienceTM核心合集數(shù)據(jù)庫(包括SCI-Expanded、CCR-Expanded、IC)作為來源數(shù)據(jù)庫,以networkpharmacology,polypharmacology等關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索,采用多元統(tǒng)計(jì)分析方法,對文獻(xiàn)發(fā)表時(shí)間、國家等外部特征進(jìn)行分析,得出發(fā)文量前4位,分別是美國、中國、德國和英國。而本文在networkpharmacology前限定了“中醫(yī)藥”,則發(fā)文量以中國為第一,遠(yuǎn)超美國等其他國家,但結(jié)合所發(fā)文章所在期刊的影響因子,可以發(fā)現(xiàn),高影響力期刊很少,多數(shù)集中在4分及以下,說明對中醫(yī)藥這一具有民族特色的醫(yī)學(xué),我們要進(jìn)行深入研究,以便更好的向世界傳播。就中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究載體而言,經(jīng)統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),復(fù)方研究的仍占多數(shù)(223/454),若將配伍和數(shù)味中藥也算作復(fù)方,則占據(jù)整個(gè)研究內(nèi)容篇次近62%。由此,也可以說明中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)符合中醫(yī)整體觀和辨證論治的思維模式,在研究中藥復(fù)方方面具有獨(dú)特優(yōu)勢,通過構(gòu)建“藥物-基因-疾病”網(wǎng)絡(luò)和利用高通量分析檢測等技術(shù),挖掘中藥復(fù)方有效活性成分及多成分間的協(xié)同作用,預(yù)測中藥復(fù)方有效成分靶點(diǎn),富集關(guān)鍵通路,從而闡釋復(fù)方的可能作用機(jī)理。若配合模型、動物、細(xì)胞、臨床等方面的進(jìn)一步驗(yàn)證,其多途徑的系統(tǒng)調(diào)控機(jī)制將會得到進(jìn)一步證實(shí),從而為臨床多分子、多靶點(diǎn)中藥新藥研發(fā)奠定基礎(chǔ)。就論文提出預(yù)測后的驗(yàn)證情況而言,與張弛等[11]對萬方數(shù)據(jù)庫2011—2019年中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)論文分析所得的結(jié)論不同,2015年有驗(yàn)證的文章占整個(gè)11.1%,從2016—2018年,有驗(yàn)證的文章比例逐漸降低;我們所得結(jié)論是從2015年開始,有驗(yàn)證的文章占所有驗(yàn)證文章的比例逐年升高,至2018年達(dá)到31.33%,很明顯發(fā)表于SCI期刊的文章質(zhì)量要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于國內(nèi)期刊,這值得我們深思。從期刊的影響因子、篇平均引用數(shù)及普賴斯指數(shù)來看,有關(guān)中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)高影響因子的文章較少,研究者最喜歡發(fā)表的SCI期刊分別是ScientificReports,F(xiàn)rontiersinPharmacology和JournalofEthnopharmacology。在統(tǒng)計(jì)分析所引用的參考文獻(xiàn)時(shí),我們以中文和英文期刊作為群組劃分,發(fā)現(xiàn)英文期刊的篇平均引用參考文獻(xiàn)數(shù)明顯高于中文期刊(P<0.001),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;但普賴斯指數(shù)比較,則差別不大。英文刊中,去除2008—2009年的發(fā)文數(shù)少的偏差,則總體普賴斯指數(shù)處于上升,但與各學(xué)科的普賴斯指數(shù)平均值大約為50%仍有差距[12],其文獻(xiàn)新穎性有待進(jìn)一步加強(qiáng)。而中文刊,從統(tǒng)計(jì)來看,波動較大,有待進(jìn)一步深入研究。

作者:倪勝樓 方明 趙笑芃 潘映辛 吳雨婷 劉芳廷 李玲孺 吳鳳芝 單位:1.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2.遼寧中醫(yī)藥大學(xué)