醫(yī)學(xué)圖像三維重建設(shè)計(jì)分析
時(shí)間:2022-03-16 11:54:05
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通過(guò)醫(yī)療設(shè)備獲取的圖像都是二維醫(yī)學(xué)斷層掃描圖像,但人體的結(jié)構(gòu)是三維的,二維圖像不能看到人體內(nèi)部的物體結(jié)構(gòu),并對(duì)人體器官的整體結(jié)構(gòu)分析造成障礙。把二維圖像進(jìn)行三維重建,重建后的圖像可以模擬人體結(jié)構(gòu),便于觀察和分析病情,因此本文通過(guò)面繪制和體繪制兩種方法對(duì)醫(yī)學(xué)圖像進(jìn)行三維重建,本文主要介紹面繪制和體繪制三維重建的理論和具體實(shí)現(xiàn)過(guò)程。
1面繪制三維圖像重建
面繪制是三維物體在二維平面的投影,是一種基于體素的表面重建,即直接從體數(shù)據(jù)提取物體表面的方法。本文以人腦圖像為例,應(yīng)用面繪制里的移動(dòng)立方體法重建三維圖像,通過(guò)輪廓提取和等值面明暗顯示兩個(gè)步驟重建三維腦部圖像。1.1輪廓提取我們主要提取腦結(jié)構(gòu)的表面形態(tài),不考慮內(nèi)部結(jié)構(gòu)特征,因此叫輪廓提取。我們對(duì)表面輪廓進(jìn)行采樣點(diǎn)提取,采樣點(diǎn)是由多個(gè)體素組成,一個(gè)體素又由8個(gè)頂點(diǎn)的多個(gè)立方體組成。首先,找到腦部的輪廓區(qū)域,計(jì)算每一個(gè)體素標(biāo)量值的所有拓?fù)錉顟B(tài),如果標(biāo)量值大于輪廓線(xiàn)的標(biāo)量值,把該體素記為屬于輪廓區(qū)域內(nèi)的點(diǎn),否則標(biāo)記為輪廓區(qū)域外的點(diǎn)。然后,尋找頭表面和背景的邊界,去掉背景區(qū)域,計(jì)算頭表面的灰度閾值G,在頭表面內(nèi)部的所有像素的灰度值都大于設(shè)定的閾值G,在頭表面的外部所有的灰度值都小于設(shè)定的閾值G。根據(jù)各頂點(diǎn)與設(shè)定的閾值的關(guān)系,把頂點(diǎn)分為2類(lèi),分別有黑、白兩色表示,遍歷立方體的每一個(gè)頂點(diǎn),如果兩個(gè)頂點(diǎn)的顏色相同,該邊上不存在邊緣點(diǎn),否則,在此邊上必然有一個(gè)邊緣點(diǎn),用直線(xiàn)將遍歷后的所有小正方形的邊上邊緣點(diǎn)連接起來(lái),并對(duì)公共邊合并,這些連接的線(xiàn)就構(gòu)成了邊界的輪廓線(xiàn),沿著邊界線(xiàn)將背景和頭表面區(qū)域分離開(kāi)。處理完一個(gè)體素后,前后移動(dòng)到另外一個(gè)體素,當(dāng)所有的體素都遍歷完后,輪廓就繪制出來(lái)了。算法的步驟為:(1)選擇一個(gè)體素。(2)計(jì)算該體素中每一個(gè)小立方體頂點(diǎn)的內(nèi)外狀態(tài)。(3)生成每個(gè)頂點(diǎn)的二進(jìn)制編碼的索引值。(4)用該索引值創(chuàng)建樹(shù)型表,并計(jì)算標(biāo)量值。(5)用樹(shù)型表計(jì)算每個(gè)點(diǎn)所連接的邊的位置。由于算法過(guò)程是對(duì)每一個(gè)體素單獨(dú)處理,一些頂點(diǎn)組成的邊緣可以會(huì)重復(fù)使用,在遍歷頂點(diǎn)的時(shí)候沿著相同的方向進(jìn)行,通過(guò)程序消除重復(fù)使用的點(diǎn)即可。遍歷所有體素是輪廓提取的重點(diǎn),本文用查表法遍歷每一個(gè)體素,將體素的八個(gè)頂點(diǎn)與閾值比較后產(chǎn)生一系列的邏輯值構(gòu)成八位索引值,通過(guò)三維圖像的256種構(gòu)型組成一個(gè)三角部分的查找表。通過(guò)查找表可以直接獲得輪廓區(qū)域的信息、索引號(hào)及指向三角部分的位置,最后找到所有三角部分的位置鑲嵌成表面輪廓。1.2等值面的明暗顯示為了真實(shí)的顯示物體表面的情況,使重構(gòu)的三維圖像更直觀,本文對(duì)用三角片構(gòu)成的物體表面設(shè)置光照效果,還要解決在特定的光照模型下的表面法向量的計(jì)算。首先,選擇光照模型,采用的光照模型為:I=Ia+(IS-Ia)cosθ,其中,I為物體表面光強(qiáng)度;Ia為環(huán)境的光強(qiáng)度;IS為光源的光強(qiáng)度;θ為入射光與表面法向量的夾角。然后,計(jì)算表面法向量,先用灰度差分法計(jì)算體素頂點(diǎn)上的灰度梯度值,再對(duì)八個(gè)頂點(diǎn)的法向量進(jìn)行線(xiàn)性插值就可以得到每個(gè)頂點(diǎn)的法向量,把計(jì)算得到的法向量值代入光照模型公式,就可以計(jì)算出表面物體的光照強(qiáng)度。最后,將其投影在某個(gè)特定的二維平面上進(jìn)行顯示,從而得到有光感效果的三維表面圖像,重建的輪廓及表面如圖1所示。
2體繪制三維圖像重建
表面繪制可以有效的繪制物體的三維表面,但缺乏內(nèi)部信息的表達(dá);體繪制可以直接由體素生成三維物體,能夠表達(dá)物體的內(nèi)部信息,傳統(tǒng)的體繪制方法主要通過(guò)點(diǎn)、線(xiàn)和幾何多邊形繪制三維物體,但繪制后,圖像的真實(shí)感欠佳。比如:最大強(qiáng)度投影法重建后可以更直觀的觀察圖像,但是不能從圖像上看出沿著光線(xiàn)的最大值,即不能清晰的觀察到單個(gè)物體及相互之間的空間關(guān)系及具體位置。因此,本文提出按照?qǐng)D像順序進(jìn)行體繪制,該方法是發(fā)出一條光線(xiàn)通過(guò)像素進(jìn)到場(chǎng)景中,然后用某一特定的為計(jì)算像素值的函數(shù)計(jì)算沿光線(xiàn)所遇到的數(shù)據(jù),確定圖像平面中每個(gè)像素值。這樣可以清晰的分辨出圖像在空間域的具體位置,使繪制后的結(jié)果更真實(shí)。圖1重建的輪廓與表面按照?qǐng)D像順序進(jìn)行體繪制也叫做光線(xiàn)投射,先確定圖像上的一個(gè)像素值,調(diào)整好相機(jī)的參數(shù)后,從相機(jī)發(fā)出一條光線(xiàn)并穿透該像素,然后用一些設(shè)定好的函數(shù)計(jì)算光線(xiàn)所遇到的數(shù)據(jù),得到具體的像素值。選定的函數(shù)不同,獲得的圖像也不同,可以從多個(gè)角度去觀察圖像,圖像觀察全面。光線(xiàn)投射是重建圖像的重要過(guò)程,本方法使用一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)正投影柵格投影。光線(xiàn)具有互相平行的特點(diǎn),并與視平面垂直,沿著每條光線(xiàn)的數(shù)據(jù)值是按照一個(gè)光線(xiàn)函數(shù)處理的,并將其轉(zhuǎn)換為灰級(jí)像素值。光線(xiàn)投射有兩個(gè)主要步驟:首先確定沿光線(xiàn)遇到那些數(shù)值,然后按一個(gè)光線(xiàn)函數(shù)處理這些數(shù)值。雖然在實(shí)現(xiàn)中這兩步典型地是結(jié)合在一起的,但這里我們單獨(dú)對(duì)待它們。由于需要按規(guī)定的光線(xiàn)函數(shù)來(lái)確定沿光線(xiàn)提取的數(shù)值,讓我們通過(guò)人腦圖像繪制的實(shí)例看看幾種不同的光線(xiàn)函數(shù)對(duì)顯示結(jié)果的影響。假設(shè)一條光線(xiàn)通過(guò)8位灰度體積數(shù)據(jù)時(shí)的數(shù)據(jù)值剖面,灰度數(shù)據(jù)值范圍為0~255。圖2是使用四個(gè)不同簡(jiǎn)單光線(xiàn)函數(shù)轉(zhuǎn)化為灰級(jí)值的顯示結(jié)果。圖2四種不同光線(xiàn)函數(shù)繪制的結(jié)果前兩個(gè)光線(xiàn)函數(shù),最大值及平均值,是對(duì)標(biāo)量值本身的基本操作。第三個(gè)光線(xiàn)函數(shù)計(jì)算沿光線(xiàn)首次遇到等于標(biāo)量值為30處的距離,第四個(gè)函數(shù)使用α合成技術(shù),將沿光線(xiàn)的值看作按單位距離累積的阻光度樣本值。并非所有的體繪制方法都可分到按圖像順序繪制。例如,體繪制的錯(cuò)切-變形法將三維視覺(jué)變換分解成三維錯(cuò)切變換和二維的變形變換。體數(shù)據(jù)按照錯(cuò)切變換矩陣進(jìn)行錯(cuò)切,投影到錯(cuò)切空間形成一個(gè)中間圖像,然后再將中間圖像經(jīng)變形生成最后的結(jié)果圖像。這種算法的最主要特點(diǎn)是按照主要的視線(xiàn)方向選擇切片數(shù)據(jù)集和投影數(shù)據(jù)。當(dāng)視線(xiàn)的方向變化時(shí),投影方向不一定變化。如果我們從體積的基平面投射光線(xiàn)做正交投影,則相當(dāng)于使體積錯(cuò)切,使光線(xiàn)變得與基平面垂直。如果所有光線(xiàn)都源自于基平面上體素中同一平面,那么,這些光線(xiàn)與該體積的每個(gè)后續(xù)平面上的體素相交在連貫的位置上。
3結(jié)論
三維重建在醫(yī)學(xué)中應(yīng)用越來(lái)越廣泛,用其作為醫(yī)生診斷病情的輔助手段,能夠極大地提高醫(yī)療診斷的準(zhǔn)確性和科學(xué)性。本文對(duì)醫(yī)學(xué)圖像三維重建進(jìn)行研究,并通過(guò)MATLAB程序設(shè)計(jì)軟件,導(dǎo)入并打開(kāi)包含DICOM格式在內(nèi)的多種醫(yī)學(xué)圖像格式,通過(guò)兩種方法重建了腦部結(jié)構(gòu),讓醫(yī)生可以通過(guò)三維影像可以更加便捷,直觀和清晰的看到細(xì)節(jié)并且做出準(zhǔn)確的判斷。醫(yī)學(xué)圖像的三維重建是計(jì)算機(jī)圖像處理技術(shù)的一個(gè)重要應(yīng)用,它將平面二維圖像變?yōu)楦又庇^的三維虛擬模型,還可以進(jìn)行術(shù)前模擬,有利于醫(yī)生對(duì)患病部位進(jìn)行分析并給出準(zhǔn)確的診療方案。
作者:唐思源 武敏 李承美 黃曉萌 單位:內(nèi)蒙古科技大學(xué)包頭醫(yī)學(xué)院計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)系
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